Un estudio innovador liderado por investigadores de la Universidad de Massachusetts Dartmouth ha puesto de manifiesto el potencial de los jugadores del videojuego de ciencia ciudadana Foldit para refinar y mejorar estructuras proteicas previamente resueltas. Este avance no solo optimiza la precisión de los datos almacenados en el Protein Data Bank (PDB), uno de los recursos científicos más relevantes del mundo, sino que también revela la capacidad de la colaboración entre científicos y ciudadanos.
Foldit es un juego de colaboración global que transforma la modelización de proteínas en un rompecabezas interactivo, permitiendo a jugadores de todo el planeta contribuir directamente a investigaciones de bioquímica de vanguardia. Estudios anteriores sobre Foldit han demostrado que los jugadores pueden superar tanto a científicos expertos como a métodos computacionales automatizados en la predicción de estructuras proteicas.
Mejoras significativas en la modelización proteica
El trabajo publicado en la revista Acta Crystallographica Section D Structural Biology analiza cómo los jugadores mejoraron modelos existentes a través de una serie de rompecabezas de reconstrucción de Foldit, basados en estructuras proteicas ya resueltas por cristalografía de rayos X o criomicroscopía electrónica y almacenadas en el PDB. Según el profesor asociado Firas Khatib, quien ha estado involucrado en el proyecto desde su inicio en 2008, «la ciencia se construye sobre descubrimientos compartidos». Khatib enfatiza que incluso pequeños errores en los modelos del PDB pueden llevar a suposiciones incorrectas en investigaciones futuras.
Los hallazgos del estudio indican que las soluciones de los jugadores de Foldit representan mejoras sustanciales sobre los modelos proteicos originales. En la mayoría de los casos, los jugadores lograron optimizar la geometría y reducir los conflictos estéricos, y en algunas instancias, mejoraron la adecuación a los datos experimentales. Además, el material suplementario del estudio incluye perspectivas de los mejores jugadores de Foldit, quienes compartieron sus diversas estrategias para abordar estos rompecabezas. Cabe destacar que dos jugadores lograron resultados superiores a los modelos originales utilizando métodos completamente automatizados, es decir, scripts o «recetas» creadas dentro de Foldit que no requerían intervención manual.
El profesor Khatib subraya que «lo particularmente impresionante es que estos algoritmos creados por los jugadores mejoraron los resultados profesionales». Esto pone de relieve la creatividad e innovación que surgen al invitar al público a participar en la ciencia real, lo que sugiere un cambio en cómo se pueden abordar los retos científicos contemporáneos.
Más información: Andreas C. Petrides et al, Reconstructing biological molecules with help from video gamers, Acta Crystallographica Section D Structural Biology (2025). DOI: 10.1107/s2059798325008149
